ناکامی برخی واکسن‌ها پس از واکسیناسیون بوقلمون‌ها می‌تواند به دلایل مختلفی مرتبط باشد. یکی از دلایل اصلی نگهداری و حمل‌ونقل نادرست واکسن‌ها است. واکسن‌ها اغلب نیازمند شرایط خاص دمایی هستند و اگر این شرایط رعایت نشود، می‌تواند اثربخشی واکسن را کاهش دهد.
زمان‌بندی نامناسب واکسیناسیون نیز می‌تواند سبب ناکارآمدی شود. واکسیناسیون در زمان نامناسب یا عدم رعایت فاصله مناسب بین واکسیناسیون‌های متوالی ممکن است ایمنی مورد انتظار را ایجاد نکند.
کیفیت خود واکسن و تولید آن نیز می‌تواند نقشی داشته باشد. اگر واکسن مورد استفاده از کیفیت پایین‌تری برخوردار باشد یا به درستی تولید نشده باشد، ممکن است نتواند ایمنی کافی ایجاد کند.
اجرای نادرست فرآیند واکسیناسیون، مانند روش‌های تزریق اشتباه یا استفاده از تجهیزات غیراستریل، نیز می‌تواند به ناکارآمدی واکسن بینجامد. کارکنان مسئول واکسیناسیون باید آموزش کافی دیده باشند و از تجهیزات مناسب استفاده کنند.
علاوه بر این، وضعیت بهداشتی و تغذیه بوقلمون‌ها پیش از واکسیناسیون نیز مهم است. پرندگانی که دچار ضعف یا استرس باشند ممکن است به واکسن واکنش مناسب نشان ندهند. رعایت اصول بهداشتی و تغذیه صحیح می‌تواند به بهبود پاسخ ایمنی کمک کند.
در نهایت، ممکن است تنوع ژنتیکی ویروس‌ها یا تکامل سریع آن‌ها باعث شود واکسن‌های موجود اثربخشی کافی نداشته باشند که در این صورت نیاز به به‌روزرسانی و بهبود فرمولاسیون واکسن‌ها وجود دارد. با توجه به این عوامل و رفع مشکلات مرتبط، می‌توان بهره‌وری واکسن‌ها را افزایش داد.
